Pagamento de fatura
Para realizar o pagamento de uma fatura em aberto, você precisa acessar:
Módulo Financeiro > Contas a Pagar > Opções > Marcar como Pago
Dentro da opção de marcar com pago, você pode definir a data do pagamento, qual caixa ou banco essa conta deverá movimentar, a condição de pagamento e o valor recebido

Após o pagamento, você poderá gerar um recibo do pagamento


Pagamento parcial
Além disso, você pode realizar o pagamento parcial da fatura. Quando é realizado um pagamento de fatura onde não é realizada a baixa do valor total, o sistema gera uma nova fatura com o valor restante
No exemplo abaixo, o valor total da fatura é de R$2300, porém eu realizei o pagamento de R$1000. Com isso, o sistema exige que seja preenchido a data de vencimento da nova fatura a ser gerada


Referência: https://revendax.scrollhelp.site/basedeconhecimento/pagamento-de-fatura