Você pode fazer a compensação de contas a receber utilizando contas a pagar do mesmo cliente
Para isso, você precisa acessar:
Módulo Financeiro > Contas a Receber > Opções > Compensar
Ao compensar uma conta, o sistema vai gerar uma nova fatura de conta a receber subtraindo o valor da conta a pagar selecionada para compensação
Referência: https://revendax.scrollhelp.site/basedeconhecimento/compensar-contas-a-receber